La municipalité offre de grandes possibilités pour les amateurs de spéléologie, car il existe de nombreuses simas et grottes cataloguées à Ataun. Il peut s’agir de deux types de systèmes karstiques: actifs ou inactifs. Les actifs sont ceux qui font partie des systèmes fluviaux. C’est le cas de Marumendi, Malkorburu et la plupart des grottes et des simas autour d’Alleku, y compris dans ce groupe la grotte d’Ubegi et celle de Malkorburu. Les inactifs, au contraire, sont issus du processus de karstification et sont des systèmes qui sont actuellement remplis de stalactites et de stalagmites. De ce dernier type sont la plupart des cavités du dome d’Ataun.
Ataun est rempli de grottes et de simas, parmi lesquelles abondent les restes humains d’il y a 5000 ans: Usategi, Limurita (disparue lors de l’exploitation de la carrière), Pikandita, Kobazar, Armontaitz, etc.
La grotte de Troskaeta est l’une des grottes les plus connues d’Ataun. Il a une longueur d’un kilomètre et finalement un beau puits d’eau. Cette grotte semble avoir été le refuge d’ours de l’espèce Ursus spelaeus il y a 20 000 ans. Des milliers d’os de cette espèce ont été trouvés.
Étant donné que la pratique de la spéléologie est une activité d’équipe, il est recommandé qu’elle soit réalisée en groupe, avec toutes les mesures de sécurité et avec le matériel approprié.
REMARQUE: Les cavités sont des habitats naturels de faune protégée. On demande toujours respect et silence et on recommande d’éviter les visites des grottes entre novembre et juillet.